市名の通り日本第2の面積を誇る霞ヶ浦に、半島のように突き出した旧霞ヶ浦町と水郷筑波国定公園の山域を背負う旧千代田町によって市域が形成されます。霞ヶ浦の水はワカサギやコイなどの漁場を育て、湖岸では水田、ハス田をもたらしてくれています。白鳥、マガモ、コサギなどの野鳥のほか、ヨシやアサザなどの水生植物が美しい環境を守っています。筑波山に連なる市西部には三ツ石森林公園をはじめ緑が豊富で、すそ野に広がる果樹栽培園は県内有数のフルーツ産地でシーズンは多くの観光客でにぎわいます。。市の北部を流れる恋瀬川、天の川などロマンチックな河川名も特徴。いにしえの常陸野の面影を色濃く残しており、神社・仏閣などの見所も点在します。